Муратов требовал признать незаконным решение Минюста о включении его в список иноагентов 1 сентября 2023 года. В ведомстве сочли, что лауреат Нобелевской премии мира за прошлый год участвует в создании и распространении сообщений и материалов иностранных агентов, направленных на формирование негативного отношения к внешней и внутренней политике РФ, использует с этой целью иностранные площадки.
Ранее МВД России заявило, что Дмитрий Муратов не участвует больше в работе Общественного совета при министерстве. Его исключили из состава палаты в 2022 году.