Согласно официальному сообщению, Звонимир Бобан ушел в отставку по собственному желанию. УЕФА выразил Бобану признательность за проделанную работу.
Однако по информации Sport 24, у Бобана возникли разногласия с президентом УЕФА Александром Чеферином. Занимавший пост директора футбольного департамента Звонимир Бобан выступал против поправок, позволяющих Чеферину в четвертый раз баллотироваться на президентский пост. Перевыборы президента УЕФА пройдут 8 февраля на конференции в Париже.
После завершения карьеры Звонимир Бобан занимал несколько руководящих должностей. С 2016 по 2019 году он был заместителем генерального секретаря ФИФА. Затем Бобан был менеджером "Милана", а с 2021 курировал ряд направлений в УЕФА.